A governança do PEDES tem a atribuição de estabelecer, aprovar, monitorar e avaliar o PEDES e é composta por:

I – Comitê Gestor do Plano Estratégico de Desenvolvimento Econômico e Social de Estado – CGPEDES;

II – Núcleo de Monitoramento e Avaliação – NUPEDES;

III – Conselho Científico de Assessoramento Técnico – CCAT;

IV – Câmara Intersetorial – CIPEDES;

V – Câmaras Técnicas – CT.

As funções de Secretaria Executiva do CGPEDES são exercidas pela Secretaria de Estado de Planejamento e Gestão – SEPLAG.